ATP棉簽拭子從冰箱中取出拭子，放置 10 分鐘，待恢復至室溫后使用； 從套管里取出拭子，一手捏住連接頭，擦拭物體表面，45°傾斜，10×10cm 表面（圖 1）； 如圖 2，將采集器插回套管； 如圖 3，一手捏住連接頭，一手捏住拭子頭內部的折斷閥，來回彎折，直至折斷閥門； 如圖 4，擠壓拭子頭 3 次，使拭子頭中的液體全部被擠出； 如圖 5，捏住拭子頭，向下輕甩 3 下拭子，立即將拭子插入儀器中檢測。

檢測原理通過檢測發光值來確定微生物體內的 ATP 含量，而活體微生物體內的 ATP 含量較為恒定， 由此可確定樣品中活體微生物的含量。國產ATP棉簽拭子完全替代進口US2020 UXL100更實惠本拭子有兩種結構，棉簽拭子的連接頭下部連有棉簽， 棉簽上含有裂解細菌等微生物的細菌裂解液；水樣采集器的連接頭下部連有吸管式水樣采集 器，套管內含有裂解細菌等微生物的細菌裂解液。拭子頭中含有可與 ATP 反應發光的酶反應 液。由棉簽采集物體表面上的樣本或水樣采集器采集液體樣本，與細菌裂解液作用，釋放出 微生物體內的 ATP，再與酶反應液混合，產生反應發光，即可用儀器讀取其發光值。